Vitor Pereira 2015/2016 sezonunun başında Fenerbahçeye getirilmişti. Fakat 20 Aralık 2021'de, Vitor Pereira Fenerbahçe'den ayrıldı. Fenerbahçe'nin açıklaması şu şekilde;
"Futbol A Takım Teknik Direktörümüz Vitor Pereira ile sözleşmesinin sonlandırılması konusunda anlaşma sağlanmış ve yollarımız ayrılmıştır. Kendisine bugüne kadar gösterdiği çaba ve çalışmalarından dolayı teşekkür eder, gelecek kariyerinde başarılar dileriz." Sarı- lacivertli takım bu açıklamayla resmen Pereira'nın takıma veda ettiğini ifade etti.
